Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA4P52798 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA4P52798 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms