Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF135P52742 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms