Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LUMP51884 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LUMP51884 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LUMP51884 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms