Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP153P49790 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP153P49790 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP153P49790 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms