Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCR1P46094 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCR1P46094 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms