Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms