Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms