Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR2P36980 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR2P36980 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR2P36980 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms