Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms