Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms