Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD13P35453 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD13P35453 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD13P35453 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD13P35453 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD13P35453 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms