Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms