Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms