Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA1P35221 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA1P35221 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms