Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRHRP34981 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRHRP34981 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRHRP34981 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRHRP34981 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRHRP34981 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRHRP34981 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRHRP34981 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRHRP34981 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms