Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM5P33992 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM5P33992 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM5P33992 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM5P33992 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM5P33992 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms