Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms