Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHC1P29353 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHC1P29353 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms