Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms