Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PLNP26678 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms