Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms