Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCSHP23434 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms