Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms