Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms