Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB1P16220 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB1P16220 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms