Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRG2P13727 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRG2P13727 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRG2P13727 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms