Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms