Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODC1P11926 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms