Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4BP0C0L5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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