Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms