Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF3P09919 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms