Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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