Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA4P06727 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA4P06727 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms