Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TK1P04183 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TK1P04183 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms