Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG7O95352 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG7O95352 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms