Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DYSFO75923 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DYSFO75923 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms