Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms