Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms