Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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