Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIAH2O43255 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms