Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBDO15205 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBDO15205 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBDO15205 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms