Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms