Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3EO15041 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3EO15041 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms