Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms