Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms