Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms