Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDCBPO00560 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms