Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms