Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN8O00124 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms