Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1D1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1D1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1D1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1D1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms